基因身份证和普通身份证在外形和基本内容上没有多大差异，主要差异在身份证号码，原来的身份证号码是由表示区域、出生日期、性别等特征的数字组成。而基因身份证主要是利用现在国内外已经非常成熟的DNA指纹（法医DNA分型）技术，选取若干个固定的基因位点进行鉴定。基因是固有的不变的遗传标记，由小孩从父母那里继承而来，只需选取若干个位点就可以鉴定出来。基因身份证的号码是由多个能够表示这些基因位点特征的数据来表示，这些选出来的基因位点的组合具有唯一性。

有人担心基因身份证可能会泄露基因隐私，甚至被坏人利用。其实，基因身份证只是显露了能够表现基因位点的个体特征，这些位点虽然可以表明两个个体之间的亲缘关系，但是不能说明个体与功能有关（如健康状况）的基因信息，所以这些位点数据仅仅是另一种更完善的身份证号码而已，也就不存在泄露隐私的问题了。

基因是包含着一个人所有遗传信息的片段，与生具有，并终身保持不变。这种遗传信息蕴含在人的骨骼、毛发、血液等所有人体组织或器官中。近年来已开发出多种遗传标记用于个体识别。其中短串联重复序列(Short Tandem Repeat 简称STR)由于检测方法简便、快速、正确度高、扩增片段大小适中，目前已发展为各法医学实验室主要的个体识别检测标记。

在含有国际标准的13个核心STR位点进行DNA检测，综合这些位点信息，个人的个体识别率已超过千亿分之一，即1000亿人之间不会有两个个体的STR基因型发生重复，完全可以进行个人同一认定。

在遭遇意外事故、失散、财产继承、试管婴儿、骨髓移植、克隆器官或克隆生命体等原因引起的需要进行个体识别和亲权鉴定中，基因身份证将发挥至关重要的作用。

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